本会は医学・生物学分野における電子顕微鏡技術研究を進め、その発展と普及を図り、これを以て広く社会に貢献することを目的とする会であります。
平たく言えば、この会の生い立ちが示すように電子顕微鏡技術者および電子顕微鏡を使用している研究者同士の情報交換のための交流の場であります。

本会の発足は昭和60年に名古屋において第1回電子顕微鏡技術者交流会として開催され、各地域にある技術者の集まりの代表者が連絡し合って合同で学術講演会を開催したのが始まりでした。
この会合がきっかけとなり2回目以降は参加人数も大幅に増え、回を重ねる度に大きく膨らんでまいりました。第3回以降は「医学・生物学電子顕微鏡技術研究会」として全国的規模での活動になりました。また、平成11年4月1日より「医学生物学電子顕微鏡技術学会」に名称を変更しました。
現在500人の会員によって構成され、毎年次のようなイベントを行っております。